In 1930 vertrok Willem Verhaart naar Batavia. Daarvoor was hij in 1925 bij Winkler gepromoveerd op het proefschrift Klinische en Anatomische Onderzoekingen over de Ziekte van Alzheimer. Ook had hij nog enkele jaren in Medemblik en Den Haag (‘Rosenburg’) gewerkt. In Batavia werkte hij aan de psychiatrisch-neurologische afdeling en begon een laboratorium voor hersenonderzoek. In de jaren dertig publiceerde hij verscheidene artikelen over neuroanatomisch onderzoek.
&ellipsis;